2008年下半年，国际金融危机对国内经济增长的不良影响开始逐步显现，外部需求萎缩导致出口大幅回落，并进一步向其他经济部门加速蔓延。我国生物医药产业出口依存度较低，同时受医药产品消费刚性、国内市场扩张和相关政策稳定的强力支撑，产业继续保持较快增长，成为此次金融危机不利影响下表现较为突出的亮点产业之一。
近两年来，随着企业经济效益上升和市场环境改善，生物医药产业投资增长加快，创业风险投资趋于活跃。2008年医药制造业完成投资1055.3亿元，同比增长27.4％，分别比2006、2007年全年增速高18.68和15.95个百分点。